Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA9P57773 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA9P57773 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA9P57773 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA9P57773 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA9P57773 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA9P57773 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA9P57773 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms