Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms