Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX4P57082 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX4P57082 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX4P57082 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX4P57082 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX4P57082 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms