Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATN1P54259 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATN1P54259 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATN1P54259 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATN1P54259 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATN1P54259 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATN1P54259 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATN1P54259 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATN1P54259 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATN1P54259 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATN1P54259 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATN1P54259 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATN1P54259 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATN1P54259 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATN1P54259 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATN1P54259 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATN1P54259 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATN1P54259 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms