Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN3P54252 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms