Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF138P52744 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF138P52744 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms