Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms