Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNA2P51530 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNA2P51530 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNA2P51530 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNA2P51530 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNA2P51530 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNA2P51530 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNA2P51530 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNA2P51530 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNA2P51530 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNA2P51530 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNA2P51530 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms