Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPT1P50897 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPT1P50897 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPT1P50897 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPT1P50897 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPT1P50897 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPT1P50897 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPT1P50897 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms