Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP153P49790 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP153P49790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP153P49790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP153P49790 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUP153P49790 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUP153P49790 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUP153P49790 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NUP153P49790 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUP153P49790 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP153P49790 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUP153P49790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUP153P49790 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NUP153P49790 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUP153P49790 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUP153P49790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP153P49790 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP153P49790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUP153P49790 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP153P49790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP153P49790 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP153P49790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUP153P49790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NUP153P49790 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NUP153P49790 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NUP153P49790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NUP153P49790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NUP153P49790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms