Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLK1P49759 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLK1P49759 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLK1P49759 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLK1P49759 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLK1P49759 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLK1P49759 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLK1P49759 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLK1P49759 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLK1P49759 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLK1P49759 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms