Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK8P49336 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK8P49336 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK8P49336 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK8P49336 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK8P49336 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK8P49336 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK8P49336 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK8P49336 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms