Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX1P48742 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX1P48742 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX1P48742 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX1P48742 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX1P48742 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX1P48742 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX1P48742 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX1P48742 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms