Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPL28P46779 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL28P46779 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL28P46779 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL28P46779 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPL28P46779 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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