Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms