Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA2P42765 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms