Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPHP41219 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPHP41219 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPHP41219 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPHP41219 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPHP41219 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPHP41219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPHP41219 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPHP41219 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms