Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP8P40818 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
USP8P40818 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP8P40818 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP8P40818 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP8P40818 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP8P40818 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP8P40818 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP8P40818 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP8P40818 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP8P40818 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP8P40818 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP8P40818 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP8P40818 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP8P40818 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP8P40818 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP8P40818 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms