Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6BP35913 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6BP35913 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6BP35913 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE6BP35913 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE6BP35913 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE6BP35913 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms