Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD13P35453 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms