Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HSPA4P34932 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA4P34932 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA4P34932 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms