Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	CAF16	YFL028C	870 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RTA1	YGR213C	954 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	OAR1	YKL055C	837 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	TVP38	YKR088C	1014 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	HEK2	YBL032W	1146 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YDR056C	YDR056C	618 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YKE4	YIL023C	1041 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RPS1B	YML063W	768 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	REX4	YOL080C	870 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SUA7	YPR086W	1038 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	OSH2	YDL019C	3852 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	KTR7	YIL085C	1554 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	MET4	YNL103W	2019 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	GGA1	YDR358W	1674 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	MRP4	YHL004W	1185 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SPO12	YHR152W	522 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	POP3	YNL282W	588 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	TMN2	YDR107C	2019 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PRP9	YDL030W	1593 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PMC1	YGL006W	3522 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	EXO70	YJL085W	1872 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PIM1	YBL022C	3402 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	HSP30	YCR021C	999 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	CPR1	YDR155C	489 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YER085C	YER085C	522 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YJR096W	YJR096W	849 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PER33	YLR064W	822 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	NCE103	YNL036W	666 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	OCT1	YKL134C	2319 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	MUM3	YOR298W	1440 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PDR12	YPL058C	4536 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RPP1A	YDL081C	321 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	COX4	YGL187C	468 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	EOS1	YNL080C	1101 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	IDI1	YPL117C	867 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	ISA2	YPR067W	558 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	NAT3	YPR131C	588 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YPR150W	YPR150W	522 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PCL10	YGL134W	1302 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	NHX1	YDR456W	1902 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	BCK2	YER167W	2556 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	GLN4	YOR168W	2430 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	AIM21	YIR003W	2040 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	DEG1	YFL001W	1329 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	LSB1	YGR136W	726 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	ECM34	YHL043W	513 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	IRC9	YJL142C	393 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YMR147W	YMR147W	672 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SUI1	YNL244C	327 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YDC1	YPL087W	954 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	EGT2	YNL327W	3126 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PRP19	YLL036C	1512 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	IDS2	YJL146W	1410 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	ENT1	YDL161W	1365 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YCR085W	YCR085W	354 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YPT53	YNL093W	663 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YNL143C	YNL143C	393 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RPG1	YBR079C	2895 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PEP5	YMR231W	3090 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	HOS2	YGL194C	1359 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YGR079W	YGR079W	1113 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	IES3	YLR052W	753 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YAR030C	YAR030C	342 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RSF1	YMR030W	1131 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SLX1	YBR228W	915 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YER077C	YER077C	2067 nt		3.29	□□□□□ -1.88

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