Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A4P31645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms