Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD11P31277 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms