Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC13P31276 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms