Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA11P31270 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms