Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF1P30408 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms