Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC27P30260 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC27P30260 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC27P30260 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC27P30260 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC27P30260 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC27P30260 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms