Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms