Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB5P28074 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB5P28074 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB5P28074 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB5P28074 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms