Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLNP26678 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLNP26678 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLNP26678 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLNP26678 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLNP26678 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLNP26678 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLNP26678 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLNP26678 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLNP26678 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms