Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTX3P26022 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTX3P26022 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTX3P26022 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTX3P26022 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTX3P26022 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTX3P26022 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTX3P26022 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTX3P26022 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTX3P26022 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms