Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KB1P23443 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KB1P23443 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms