Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-210ENST00000496123 693 ntTSL 59.8□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-213ENST00000539999 405 ntTSL 34.19□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-212ENST00000497983 534 ntTSL 414.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-203ENST00000434222 1852 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-211ENST00000491741 1188 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-214ENST00000498771 858 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-205ENST00000465351 1930 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-210ENST00000489022 577 ntTSL 410.44□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 AKR1B1-209ENST00000487438 557 ntTSL 410.25□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-19■■■■■ 31.6
RPS3P23396 CAT-203ENST00000528104 354 ntTSL 28.52□□□□□ -1.057e-8■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-216ENST00000587820 652 ntTSL 314.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-227ENST00000591437 2828 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-214ENST00000586429 575 ntTSL 57.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-213ENST00000586390 566 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 SEC14L1-228ENST00000591786 548 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 28.14□□□□□ -1.118e-10■■■■■ 31.6
RPS3P23396 CCT4-203ENST00000461540 638 ntTSL 31.91□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-225ENST00000557415 584 ntTSL 221.84■■□□□ 1.099e-9■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-216ENST00000554867 555 ntTSL 219.4■□□□□ 0.79e-9■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-212ENST00000553787 579 ntTSL 419.12■□□□□ 0.659e-9■■■■■ 31.6
RPS3P23396 EIF2B3-206ENST00000480675 1082 ntTSL 518.49■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 EIF2B3-205ENST00000477953 828 ntTSL 514.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-211ENST00000553641 800 ntTSL 310.83□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 31.6
RPS3P23396 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-217ENST00000554910 577 ntTSL 49.74□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-223ENST00000556616 571 ntTSL 47.31□□□□□ -1.249e-9■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PRMT5-208ENST00000553417 259 ntTSL 36.3□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 EIF2B3-204ENST00000439363 892 ntTSL 35.77□□□□□ -1.494e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 MARS-224ENST00000551805 479 ntTSL 24.28□□□□□ -1.729e-8■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PSMA2-202ENST00000411875 4251 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 213.58□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 311.96□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 HMBS-219ENST00000544182 1542 ntTSL 213.53□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 PEPD-210ENST00000591968 943 ntTSL 214.7□□□□□ -0.067e-8■■■■■ 31.6
RPS3P23396 APOA5-202ENST00000433069 526 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 ANXA1-203ENST00000415424 526 ntTSL 42.71□□□□□ -1.986e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.227e-9■■■■■ 31.6
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RPS3P23396 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 31.5
RPS3P23396 NUBP2-212ENST00000568287 839 ntTSL 518.52■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 31.5
RPS3P23396 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 31.5
RPS3P23396 NUBP2-202ENST00000562263 811 ntTSL 317.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 31.5
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RPS3P23396 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 31.5
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RPS3P23396 CORO1C-213ENST00000550032 547 ntTSL 27.55□□□□□ -1.23e-10■■■■■ 31.5
RPS3P23396 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 37.4□□□□□ -1.223e-10■■■■■ 31.5
RPS3P23396 CORO1C-207ENST00000547170 804 ntTSL 46.98□□□□□ -1.293e-10■■■■■ 31.5
RPS3P23396 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 31.5
RPS3P23396 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 31.5
RPS3P23396 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.469e-7■■■■■ 31.5
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RPS3P23396 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 31.5
RPS3P23396 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 31.5
RPS3P23396 UROD-208ENST00000463092 968 ntTSL 214.69□□□□□ -0.066e-10■■■■■ 31.5
RPS3P23396 HYOU1-213ENST00000533381 694 ntTSL 319.15■□□□□ 0.661e-11■■■■■ 31.4
RPS3P23396 EIF4A1-204ENST00000577731 574 ntTSL 23.34□□□□□ -1.873e-12■■■■■ 31.4
RPS3P23396 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 31.4
RPS3P23396 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 31.4
RPS3P23396 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 31.4
RPS3P23396 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 31.4
RPS3P23396 PSMB7-202ENST00000441097 650 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 31.4
RPS3P23396 STT3A-205ENST00000525946 1383 ntTSL 24.92□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 31.4
RPS3P23396 ACTBP2-201ENST00000515712 1123 ntBASIC10.83□□□□□ -0.687e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.182e-16■■■■■ 31.4
RPS3P23396 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 12e-16■■■■■ 31.4
RPS3P23396 HSPE1-206ENST00000473395 569 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-16■■■■■ 31.4
RPS3P23396 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.212e-16■■■■■ 31.4
RPS3P23396 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 212.29□□□□□ -0.448e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 420.66■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 VKORC1-206ENST00000420057 746 ntTSL 213.77□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 31.4
RPS3P23396 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 31.4
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