Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BGNP21810 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BGNP21810 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BGNP21810 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BGNP21810 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BGNP21810 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BGNP21810 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BGNP21810 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BGNP21810 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BGNP21810 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BGNP21810 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BGNP21810 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BGNP21810 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BGNP21810 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms