Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EPHA1P21709 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms