Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT1P21579 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT1P21579 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT1P21579 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT1P21579 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT1P21579 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT1P21579 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT1P21579 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT1P21579 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT1P21579 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT1P21579 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT1P21579 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT1P21579 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYT1P21579 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT1P21579 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms