Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2EP19388 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms