Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6P18850 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6P18850 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6P18850 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6P18850 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6P18850 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6P18850 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6P18850 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms