Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PDE6GP18545 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6GP18545 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6GP18545 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6GP18545 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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