Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB5P18084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms