Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP1P17987 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCP1P17987 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TCP1P17987 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCP1P17987 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP1P17987 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP1P17987 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP1P17987 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP1P17987 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP1P17987 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP1P17987 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP1P17987 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP1P17987 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms