Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GM2AP17900 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GM2AP17900 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GM2AP17900 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GM2AP17900 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GM2AP17900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GM2AP17900 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GM2AP17900 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GM2AP17900 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GM2AP17900 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GM2AP17900 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GM2AP17900 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GM2AP17900 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GM2AP17900 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms