Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A2P16615 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A2P16615 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms