Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB1P16220 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB1P16220 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CREB1P16220 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB1P16220 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB1P16220 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB1P16220 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB1P16220 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB1P16220 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB1P16220 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB1P16220 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB1P16220 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB1P16220 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB1P16220 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB1P16220 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB1P16220 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB1P16220 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB1P16220 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB1P16220 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB1P16220 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms