Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms