Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF4P15884 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF4P15884 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF4P15884 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF4P15884 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF4P15884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF4P15884 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF4P15884 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms