Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB2P14652 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB2P14652 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms