Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms