Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN1P12814 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms